2015年10月6日，生命科学学院博士生李渊越以第一作者在Nature子刊《Nature Methods》上发表题为“Group-DIA: analyzing multiple data-independent acquisition mass spectrometry data files”的文章。

　　在生物学研究中，比较多个样品中蛋白量的变化是经常要解决的问题。定量蛋白组作为一个很重要的技术手段，经常被用来寻找多个生物样品中有差异变化的蛋白。SWATH-MS是一种新型的蛋白质定量技术，其拥有高定量精度和良好的多样品定量一致性等特点，可以用来寻找多个生物样品中的差异表达蛋白。虽然SWATH-MS技术具有很多优点，但是其数据处理一直是个难题。现有两款软件OpenSWATH和DIA-Umpire，其中OpenSWATH作为最先被报道的软件，其在数据处理方面较繁琐，DIA-Umpire在数据处理方面具有优势，但鉴定肽段数量方面稍显弱势。

　　韩家淮教授课题组开发了一个名为Group-DIA的SWATH数据处理软件，其在数据处理方面和DIA-Umpire具有相同优势，在鉴定肽段数量方面比DIA-Umpire软件多30-50%。课题组研究人员对TNFR1（TNF 受体蛋白1）免疫共沉淀样品的SWATH数据进行了分析，发现Group-DIA软件可以比其他两款软件鉴定出更多的TNFR1相互作用蛋白，假阳性率则较其他两款软件低。综上所述，Group-DIA软件是目前分析SWATH数据最好的软件，它的开发推动了SWATH-MS在生物学研究中的应用，为寻找信号通路中的关键节点蛋白提供了很好的途径。

　　韩家淮教授课题组的博士生李渊越和博士后钟传奇承担了该论文的主要工作，通讯作者为博士后钟传奇和韩家淮教授。

　　全文链接：http://www.nature.com/nmeth/journal/vaop/ncurrent/full/nmeth.3593.html